根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二条规定，为了公共利益的需要，征收国有土地上单位、个人的房屋，应当对被征收房屋所有权人（被征收人）给予公平补偿。

第二十六条规定，被征收房屋所有权人不明确的，由房屋征收部门报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府依照本条例的规定，按照征收补偿方案作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告。政府部门为了公共利益的需要，有权对产权不明的房屋依法作出征收决定，但应依法作出补偿安置。征收部门绝不能以产权关系不明确、被征收主体不明确为由就降低或不对被征收房屋进行补偿，根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定，被征收房屋所有权人不明确的，应按照征收补偿方案作出补偿决定，并予以公告，同时明确补偿决定应当公平。

新补偿条例相较于以往旧拆迁条例而言，为保障被征收人的合法权益，政府职能实现了回归，从商业拆迁转身为公益征收，法律关系亦由以往的拆迁补偿型转变为征收补偿型，政府不再作为中立的第三方，也不再享有行政裁决权。征收双方由纯粹的平等主体变成一方为政府，另一方为行政相对人，补偿协议亦由纯粹的民事协议变为带有公法色彩的行政协议。

对于产权不明的被征收房屋作出补偿决定，是行政法规赋予政府的一项法定职责，其不能也无权拒绝，不能因为被征收主体不明确，就降低或不对被征收房屋进行补偿。

因为在公益征收过程中，按照国家逻辑和行政管理规律运作，是否征收、补偿标准如何都因征收的公益性而具有一定的行政强制执行力。这就意味着哪怕对补偿对象有争议，政府也必须依法作出房屋征收补偿决定，而不能因被征收物产权不明而影响整个征收工作的进程。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十六条规定，对于产权不明的房屋，也应该严格按照征收补偿方案的要求作出补偿安置。